2) Changer le format des images

Les images fournies par la machine IRM GE à 1.5T sont des images au format DICOM.
Or SPM2 utilise des images au format ANALYZE.
Afin de changer le format des images il faut utiliser le programme MRIcro et procéder comme suis :

1) Ouvrir MRIcro

2) Aller dans le menu déroulant "Import" et cliquer sur "Convert Foreign to analyze"

3) Une boite de dialogue apparait. Dans "Number of files", mettre le nombre d'images de la série à convertir. Si c'est une série fonctionnelle, mettre le nombre de volume acquis au cours de la série dans "Volumes". Puis cocher les options comme suit :

Attention : Ne cocher "Interleaved" que si l'acquisition des images s'est faite en mode entrelacé

4)Cliquer sur "Select" et dans le répertoire qui contient vos images, séléctionnez la première image de la série.

5)Cliquer sur ok et attendre la fin du processus.

6)Selectionner ensuite le répertoire de destination de la nouvelle image ainsi que son nom. Cliquer sur ok et attendre la fin du processus.

7)Dans le répertoire de destination, MRIcro a crée une image contenant tous les volumes de la série traitées ainsi qu'un fichier header correspondant (Format Analyze).

8) Faire de même pour toutes les séries d'images.